При продаже товара агент от своего имени выставляет обычные счета-фактуры с НДС на отгрузку и полученные авансы, даже если он применяет УСН. Эти счета-фактуры агент регистрирует в журнале учета, принципалу направляет копии. В книгу продаж их вносить не надо п. 20 Правил ведения книги продаж, Письмо Минфина от 19.07.2017 N 03-07-09/45747.