Отсутствие первичных документов в налоговом учете чревато следующими последствиями:
(и) расходы, не подтвержденные документами, нельзя учитывать при исчислении налога (п.1 ст.252, п. 2 ст. 346.16 НК РФ). Если данные затраты вы все-таки признали при налогообложении, то при проверке налоговики их со стопроцентной вероятностью исключат из состава расходов (конечно, если они выявят эту ошибку). Суды в этом вопросе могут поддержать инспекцию (Постановление ФАС Дальневосточного округа от 08.05.2008 NФ03-А59/08-2/1401);
(и) отсутствие первичных документов может стать причиной для наложения штрафа за грубое нарушение правил учета доходов, расходов и объектов налогообложения (ст. 120 НК РФ). Если нехватка документов повлекла занижение налоговой базы, штраф может составить 20% от суммы неуплаченного налога, но не менее 40 000 руб. (п.3. ст.120 НК РФ);
(и) за непредставление документов в установленный срок по требованию инспекции грозит штраф в размере 200 руб. за каждый документ (п.1. ст.126 НК РФ).
Если в течение 2015 г. в отношении вашей организации не будет вынесено решение о проведении выездной налоговой проверки, то беспокоится вам будет уже не о чем. Ведь налоговики могут проверить налоги только за период, который не превышает трех календарных лет, предшествующих году вынесения решения о проведении проверки (абз. 2 п. 4 ст. 89 НК РФ). Однако если в будущем вы примете решение о подаче уточненной декларации за 2012 год, вы тем самым можете инициировать выездную проверку за этот период. Ведь в таком случае проверить корректируемый период можно даже в случае, если он выходит за пределы трех календарных лет, предшествующих вынесению решения о проведении проверки (абз. 3 п. 4 ст. 89 НК РФ).
Правда, у вас есть возможность снизить размер штрафа по ст. 120 НК РФ, если вы сами исключите неподтвержденные затраты из состава расходов для целей налогообложения и сдадите уточненку.