Неотъемлемые приложения к договору составляются для того, чтобы детализировать его условия. Поскольку договор - это соглашение двух или более сторон (п.1 ст. 420 ГК РФ), то и приложения к нему также должны быть предметом соглашения тех же сторон. Иначе говоря, приложением к договору можно признавать документы, которые согласовываются и подписываются всеми сторонами договора. Типичные примеры – спецификация на товары или график поставок.
Первичные документы, которые оформляет одна из сторон в целях реализации договора (счета, накладные и т.д.), приложением к договору быть не могут.
Относительно рисков при отсутствии спецификаций можно сказать следующее.
Условие о товаре – это существенное условие договора поставки (п.1, 5 ст. 454, ст. 506 ГК РФ). Оно считается согласованным, если договор позволяет определить наименование и общее количество товара (п.3 ст. 455 ГК РФ.) В противном случае договор могут признать незаключенным в судебном порядке, например, по иску покупателя, если с ним возникнет спор (п.1 ст. 432 ГК РФ).
Однако у вас есть накладные на конкретные партии товара, в которых указан ассортимент и количество. Следовательно, можно говорить о заключении разовых сделок купли-продажи (Постановлении ФАС ЗСО от 26.10.2011 N А75-10601/2010). Ведь письменная форма договора считается соблюденной и тогда, когда сторона, получившая письменную оферту (накладную), выполнила указанные в ней действия (приняла и оплатила товар) (п.2 ст. 432 ГК РФ, Постановления ФАС ПО от 14.02.2012 N А65-14077/2011; ФАС ВВО от 17.05.2012 N А43-25468/2011; ФАС МО от 06.09.2010 N КА-А40/9922-10). На основании накладной вы можете требовать оплаты поставленного товара. Другое дело, что в случае признания общего договора незаключенным вы не сможете реализовать другие его положения (например, в части санкций и штрафов).
Что касается налоговых рисков, то для вас, как для поставщика, отсутствие договора как единого документа никаких неблагоприятных налоговых последствий не влечет. Доход от реализации вы в любом случае показываете на момент перехода права собственности на товары (п.3 ст. 271, п.1 ст. 39 НК РФ), НДС исчисляется к уплате в бюджет по отгрузке (подп.1 п.1 ст. 167 НК РФ).
Подробнее о рисках работы только по счету или накладной читайте в ГК, 2012, N 19, с. 52.