С 1 января 2016 г. изменяются правила обложения НДФЛ доходов от продажи недвижимости, которую вы приобрели и зарегистрировали на нее право собственности после 1 января 2016 г. (п. 3 ст. 4 Закона от 29.11.2014 № 382-ФЗ).
В вашем же случае квартиры были получены в собственность до 01.01.2016. Поэтому применяются старые правила. При продаже в 2016 году квартир, которые вы получили по договору дарения и при приватизации, вы платить НДФЛ не должны. Ведь они находились у вас в собственности более трех лет (п. 17.1 ст. 217 НК РФ в редакции, действующей до 01.01.2016). Причем подавать декларацию 3-НДФЛ и отражать там доходы от продажи двух квартир тоже не нужно (подп. 2 п. 1 ст. 228, п. 1 ст. 229 НК РФ).