Этот вопрос мы задали специалисту ФНС и получили такой ответ: 

ГУСЬКОВА ЛАРИСА АЛЕКСАНДРОВНА - Советник государственной гражданской службы РФ 2 класса

Налоговый агент по итогам налогового периода должен представлять в инспекцию документ, содержащий сведения о суммах начисленного и фактически полученного  физическим лицом дохода и суммах исчисленного, удержанного и перечисленного налога  <п. 2 ст. 230 НК РФ>. Таким образом, само определение формы 2-НДФЛ  подразумевает, что представлять ее надо только в том случае, когда организация (или индивидуальный предприниматель) начисляет доход в пользу физического лица. Если же организация (ИП) не начисляет в пользу физических лиц доходы, она (он) налоговым агентом не является. Обязанность представлять нулевую справку 2-НДФЛ, если в течение всего года никаких начислений в пользу физических лиц не было, нигде не прописана. Поэтому представлять нулевую справку 2-НДФЛ в такой ситуации не нужно. 

Но имейте в виду, что если организация весь год не ведет деятельность и не начисляет зарплату сотрудникам, налоговая инспекция вправе затребовать объяснения, с чем это связано <ст. 24 НК>.