При нарушении установленного 5-дневного срока для представления пояснений хотя бы на 1 день налоговый орган вправе оштрафовать налогоплательщика на 5000 руб. (п. 1 ст. 129.1 НК РФ). Однако при наложении санкции налоговики должны устанавливать и учитывать наличие смягчающих обстоятельств <п. 4 ст. 112 НК РФ>. В вашем случае такое обстоятельство есть – незначительный период просрочки представления пояснений.
Напомним, что при наличии хотя бы одного смягчающего обстоятельства штраф должен быть снижен минимум вдвое <п. 3 ст. 114 НК РФ, Постановление 4 ААС от 08.08.2018 N 04АП-2442/2018>. На практике налоговики могут снизить штраф и в 10 раз <Постановление 17 ААС от 19.06.2018 N 17АП-6262/2018-АК>.
Если смягчающие обстоятельства не были учтены вашей ИФНС и штраф не снижен, то в течение 1 месяца со дня получения акта о правонарушении направьте в налоговую ходатайство об учете смягчающих обстоятельств.