При суммированном учете сверхурочной работой считается работа сверх нормального числа рабочих часов за рабочий период (ст. 99 ТК РФ). Таким образом, если у работников по итогам их учетных периодов (месяц, год)  будет превышение нормы, то эти часы должны быть оплачены как переработка (ст. 152 ТК РФ):     

(и) первые два часа работы не менее чем в полуторном размере,

(и) последующие часы - не менее чем в двойном размере.

Либо можно вместо повышенной оплаты при желании работника предоставить ему дополнительное время отдыха, но не менее времени, отработанного сверхурочно.

Напомним также, что при определении нормы рабочего времени время отсутствия по уважительным причинам нужно исключать (Письмо Роструда от 01.03.2010 № 550-6-1). То есть если работник, к примеру, болел или был в отпуске, то при подсчете часов его переработки за учетный период нужно ориентироваться не на стандартную норму рабочего времени, а на уменьшенную для данного работника.