Если вы после оценки своих налоговых рисков решили уточнить налоговые обязательства, то ответ в ИФНС можно не составлять, а сразу подать нужные уточненные декларации и доплатить необходимую сумму в бюджет, указав в платежке, что уточняете такой-то налог за такой-то период в рамках побуждения налоговым органом к добровольному уточнению налоговых обязательств.
Если уточнять налоговые обязательства вы не планируете, то ответ составляйте, как обычные пояснения, то есть в произвольной форме и с обоснованием вашей позиции по сложившейся ситуации. Не лишним будет указать, что вы проявляете должную осмотрительность при выборе контрагентов (если это так). Дополнительную информацию о том, как написать пояснения в налоговую, читайте на нашем сайте:https://glavkniga.ru/situations/k500998.