По общему правилу срок камеральной проверки декларации по НДС составляет два месяца <п. 2 ст. 88 НК РФ>. То есть, если вы, к примеру, подали НДС-декларацию за 2 квартал 27 июля, то стандартный срок проверки уже должен был закончиться 28 сентября (так как 27 сентября – воскресенье).

Однако он может быть продлен до трех месяцев, если инспекция установит признаки возможного нарушения налогового законодательства. К примеру, выявит НДС-разрывы.

   Причем, по мнению Минфина, сотрудники ИФНС не обязаны сообщать налогоплательщику о продлении срока проведения камеральной проверки представленной им НДС-декларации <Письмо Минфина от 02.10.2018 N 03-02-07/1/70615>. Хотя такое продление оформляется решением руководителя ИФНС. И в нем предусмотрена строка для налогоплательщика, что он ознакомлен с решением <Приложение № 3 к Приказу ФНС от 07.11.2018 № ММВ-7-2/628@>.

Вполне вероятно, что ваша инспекция воспользовалась своим правом молчаливого продления камеральной проверки с 2-х до 3-х месяцев. Ведь три месяца истекут только в конце октября.