ОП находится в том же субъекте РФ, что и головная организация. Налог отдельно за ОП можно не рассчитывать и не платить. Для этого подайте в ИФНС организации Уведомление N 1, а в ИФНС подразделения - Уведомление N 2 Письмо Минфина от 03.07.2017 N 03-03-06/1/41778.

Срок для уведомления - 10 рабочих дней после окончания квартала открытия ОП. Если не успеете, перейти на централизованную уплату можно будет только со следующего года, подав уведомления до 31 декабря ст. 288 НК РФ.

ОП в другом субъекте РФ. Отдельно платите налог в региональный бюджет и сдавайте декларацию в ИФНС, где ОП стоит на учете. Вести налоговый учет доходов и расходов подразделения не надо - налог считайте по доле прибыли ОП в прибыли всей компании.

В декларацию по ОП включите только Приложение 5 и подразделы с суммами к уплате. В декларацию по организации включите Приложения 5 по каждому ОП и по организации без ОП. В Листе 02 покажите налог по всей компании, но в подразделах 1.1 и 1.2 покажите региональные платежи по организации без ОП.

Несколько ОП в одном субъекте РФ. Можно не платить налог по каждому из них, а выбрать ответственное подразделение и считать налог за него по доле прибыли всех ОП региона. Для этого отправьте Уведомление N 1 в инспекции ответственного ОП и головной организации, а в инспекции остальных ОП - Уведомление N 2. Сроки - те же, что и при переходе на централизованную уплату налога в своем регионе Письмо ФНС от 30.12.2008 N ШС-6-3/986.