Расходы, связанные с приобретением неисключительных прав на использование программ для ЭВМ и баз данных, относятся к прочим <пп. 26 п. 1 ст. 264 НК РФ>.
При применении метода начисления расходы признаются таковыми в том отчетном (налоговом) периоде, к которому они относятся <п.1 ст.272 НК РФ>.
По мнению Минфина, расходы на приобретение неисключительных прав на компьютерные программы нужно признавать равными частями в течение срока действия лицензии на их использование <Письма Минфина от 31.08.2012 N 03-03-06/2/95, от 25.05.2012 N 03-03-06/1/276, 05.05.2012 N 07-02-06/128>.
Поскольку в вашем договоре прописано приобретение трех отдельных последовательных лицензий, то безопаснее списывать затраты на каждую лицензию в течение срока ее действия. То есть, затраты на покупку первой лицензии списываете в течение года начиная с  марта 2016 года, второй - в течение следующего года и т.д.
Учтите, что Минфин настаивает на равномерном списании расходов и на последующую модификацию, адаптацию и иные работы по усовершенствованию программного продукта. Их надо признавать в течение срока использования усовершенствованной программы <Письма Минфина от 18.03.2014 N 03-03-06/1/11743, от 18.03.2013 N 03-03-06/1/8161>.
Но есть и другой подход. Из Налогового кодекса прямо не следует, что такие расходы непременно нужно распределять. Поэтому некоторые компании списывают их сразу. Однако отстаивать свою правоту им приходится в суде <Постановления ФАС МО от 18.03.2014 N Ф05-1208/2014, от 14.11.2013 N А40-120812/12>.