Реализация медицинского оборудования не облагается НДС, если медицинские товары освобождены от НДС.
Если освобождение не применяется, то продажа медицинского оборудования облагается НДС в общем порядке: по ставке 10% или 20% (к вычету принимается в соответствии с п. 2 ст. 171, ст. 172 НК РФ).
Освобождение от НДС действует при одновременном соблюдении условий указанных в пп. 1 п. 2 ст. 149 НК РФ. Отказаться от освобождения от НДС реализации медицинского оборудования нельзя.