Если вы приняли к учету выполненные работы только в 3 квартале 2020 года, то в этом квартале у вас и появилось право на вычет агентского НДС.
Напомним, что вы можете принять НДС к вычету при соблюдении следующих условий (п. 3 ст. 171, ст. 172 НК РФ):
- вы являетесь плательщиком НДС;
- есть платежные документы, подтверждающие уплату удержанного НДС в бюджет;
- работы приобретены для использования в деятельности, облагаемой НДС;
- работы приняты вами к учету (Письмо Минфина от 26.01.2015 N 03-07-11/2136);
- вы как агент оформили счет-фактуру в установленном порядке (п. 3 ст. 168 НК РФ).
При перечислении аванса иностранному исполнителю вы не могли принять к вычету агентский НДС – поскольку у вас не было счета-фактуры продавца (а это обязательное условие для вычета авансового НДС).
Поэтому при заявлении вычета агентского налога по самим работам не придется ничего восстанавливать <п. 12 ст. 171 НК РФ, Письма Минфина от 20.03.2018 N 03-07-08/17279, ФНС от 12.08.2009 N ШС-22-3/634@, Решение ВАС РФ от 12.09.2013 N 10992/13>.