Производственный кооператив – это коммерческая организация (п.2 ст. 50 ГК РФ). Поэтому налоговый учет расходов ведется по общим правилам, установленным НК для коммерческих организаций. Однако трудовые отношения членов кооператива регулируются не ТК РФ, а Законом о производственных кооперативах и уставом кооператива (п.1 ст. 19 Закона от 08.05.96 N 41-ФЗ). 

Данный Закон устанавливает, что кооператив самостоятельно определяет формы и системы оплаты труда членов кооператива и закрепляет их в положении об оплате труда. Таким образом, для ответа на ваш вопрос необходимо обратиться к положениям вашего устава.  Если в нем есть положения, аналогичные  статьям ТК о командировках, и данная поездка оформлена как командировка, то вы можете учесть суточные и расходы на проживание в прибыльных расходах на основании  подп.12 п.1 ст. 264 НК РФ.