Размер суточных, а также выбор нормативов устанавливается самой организацией – в коллективном договоре или в локальном нормативном акте, посвященном командировкам <ст. 168 ТК РФ>.

Как правило, для российских и зарубежных командировок предусматриваются различные размеры суточных. Причем размер "заграничных" суточных может варьироваться в одной организации, к примеру, в зависимости от страны командирования. 

По умолчанию за дни пересечения границы суточные выплачиваются так <пп. 17, 18 Положения, утв. Постановлением Правительства от 13.10.2008 N 749>:

<если> работник следует из РФ в другую страну, то за день пересечения границы суточные ему выплачиваются как за дни нахождения за рубежом;

<если> работник возвращается в Россию, то за день пересечения границы суточные ему выплачиваются как за дни нахождения на территории РФ. Причем неважно, в какое время суток была пересечена граница – хоть в 00.30, хоть в 23.30.

В описанной ситуации работник по окончании командировки обратно в РФ не возвращался, то есть факта пересечения границы не было. Поэтому если у вас в локальном акте нет иных правил, суточные за последний день командировки нужно выплатить по норме, предусмотренной в компании для зарубежных командировок, либо для командировок конкретно в Австралию.