ПФР обнаружил расхождение между данными форм СЗВ-М, СЗВ-СТАЖ и СЗВ-ТД, поэтому вы и получили уведомление.
Направьте в ПФР письмо с объяснением причины расхождения. В пояснениях сошлитесь на Письмо Минтруда от 24.03.2020 № 14-2/В-293, где сказано, что в отношении руководителя — единственного учредителя, с которым не заключен трудовой договор, представлять СЗВ-ТД не требуется.
Что же касается отчетов по форме СЗВ-М и СЗВ-СТАЖ, то их, по мнению Минтруда и ПФР, нужно подавать и на «бездоговорных» руководителей — единственных учредителей. Поскольку для целей пенсионного страхования они признаются состоящими в трудовых отношениях с организацией <Письма Минтруда от 16.03.2018 № 17-4/10/В-1846; ПФР от 07.06.2018 № 08/30755>.
Однако если несмотря на отсутствие трудового договора с директором – единственным учредителем, в его трудовой книжке вы все-таки сделали запись о приеме на работу, скажем на основании решения учредителя, то форму СЗВ-ТД с этими сведениями вам нужно было подать в ПФР. Вы можете сделать это сейчас, указав в СЗВ-ТД дату приема директора на работу, кадровое мероприятие ПРИЕМ, название должности, код трудовой функции (с 01.07.2021 – в обязательном порядке), реквизиты документа, на основании которого вы сделали запись в трудовой книжке. Но нужно быть готовым административным санкциям, так как срок подачи сведений уже пропущен.