1) По вашему первому вопросу читайте ответ выше в вопросе "Срок для выплаты отпускных".
2) Зарплату нужно выплатить в срок, установленный в вашей организации правилами внутреннего трудового распорядка, коллективным договором или трудовым договором (но не позднее 15 календарных дней со дня окончания периода, за который она начислена) <ст. 136 ТК>.
Как мы поняли из вопроса, в вашей организации срок выплаты зарплаты за май приходится на 10 июня. Поскольку в 2018 году это выходной, то выплатить зарплату всем, в том числе и находящемуся в отпуске работнику, вы должны в субботу 9 июня (является в 2018 году рабочим днем) <ст. 14, 136 ТК, Постановление Правительства от 14.10.2017 N 1250>.
Обязанность выплачивать зарплату за истекший месяц непременно до начала отпуска или одновременно с отпускными законодательством не предусмотрена. Более того, перечисление зарплаты ранее установленного в организации срока может привести к нарушению ТК, в соответствии с которым интервал между выплатами зарплаты должен составлять полмесяца <ст. 136 ТК>.
В разделе 2 расчета 6-НДФЛ зарплата и отпускные в большинстве случаев отражаются отдельными блоками, поскольку у них не совпадают:
– даты получения дохода: у зарплаты это последний день того месяца, за который она начислена <п. 2 ст. 223 НК>, у отпускных – день выплаты <подп. 1 п. 1 ст. 223 НК>;
– срок уплаты в бюджет исчисленного и удержанного налога: для НДФЛ с зарплаты это следующий рабочий день, для НДФЛ с отпускных – последний день того месяца, в котором они выплачены <п. 6 ст. 226 НК>.
Раздел 2 расчета 6-НДФЛ в вашем случае – в зависимости от того, когда вы на деле выплатили зарплату за май и отпускные, – нужно заполнить так.
Случай 1 (самый правильный вариант). Отпускные выплачены 31 мая, зарплата – 9 июня. Обе выплаты отражаются в разделе 2 расчета за полугодие.
Отпускные: в строках 100, 110 и 120 – 31.05.2018.
Зарплата: в строке 100 – 31.05.2018, в строке 110 – 09.06.2018, в строке 120 – 13.06.2018 (т.к. следующий за 9 июня рабочий день – 13 июня) <ст. 112 ТК, Постановление Правительства от 14.10.2017 N 1250>.
Случай 2. И отпускные, и зарплата выплачены 1 июня.
Отпускные отражаются в разделе 2 расчета за 9 месяцев: в строках 100 и 110 – 01.06.2018, в строке 120 – 02.07.2018 (последний день июня в 2018 г. приходится на выходной, поэтому крайний срок уплаты НДФЛ с отпускных переносится на следующий рабочий день – 2 июля, а это уже III квартал) <Письмо ФНС от 05.04.2017 № БС-4-11/6420@; п.13 Письма ФНС от 01.11.2017 № ГД-4-11/22216@>.
Зарплата отражается в разделе 2 расчета за полугодие: в строке 100 – 31.05.2018, в строке 110 – 01.06.2018, в строке 120 – 04.06.2018.
Случай 3. Отпускные выплачены 1 июня, зарплата – 9 июня.
Отпускные отражаются в разделе 2 расчета за 9 месяцев: в строках 100 и 110 – 01.06.2018, в строке 120 – 02.07.2018.
Зарплата отражается разделе 2 расчета за полугодие: в строке 100 – 31.05.2018, в строке 110 – 09.06.2018, в строке 120 – 13.06.2018.
Как видим, в любом из трех случаев зарплата и отпускные будут отражены в разделе 2 расчета отдельными блоками.
Во всех трех случаях зарплата и отпускные, а также исчисленный с них НДФЛ должны быть отражены в разделе 1 расчета за полугодие (в строках 020, 040, 070), т.к. у них даты получения дохода, исчисления и удержания НДФЛ приходятся на II квартал.
3) При расчете отпускных весь период отпуска без сохранения зарплаты нужно исключить из расчетного периода <п. 4, подп. «е» п. 5 Положения, утв. Постановлением Правительства от 24.12.2007 N 922>.
Как отражать операции в программе 1С, уточните у разработчика данной программы.