Перевод долга с должника на другое лицо может быть произведен по соглашению между первоначальным должником и новым должником с согласия кредитора. При этом обычно у нового должника есть какие-то обязательства перед первоначальным должником, которые прекращаются на дату перевода долга <п. п. 1, 2 ст. 391, ст. 410 ГК РФ>.
Нам неизвестны условия соглашения о переводе долга между физлицом и вашей организацией. Вы упоминаете о погашении долга физлицом перечислением денег, поэтому можем предположить, что фактически ваша организация предоставила заем физлицу, погасив его долг перед организацией «А».
К расчетам, при проведении которых следует применять ККТ, относятся предоставление и погашение только таких займов, которые заимодавец выдает на оплату приобретаемых непосредственно у него самого товаров, работ, услуг. То есть для целей ККТ выдача займа - это предоставление отсрочки (рассрочки) по оплате товаров, работ, услуг, погашение займа ‑ оплата покупателем полученных им ранее товаров, работ или услуг <ст. 1.1, п. 1 ст. 1.2 Закона от 22.05.2003 N 54-ФЗ, Письма ФНС от 25.10.2018 N ЕД-3-20/7645@, от 19.10.2018 N ЕД-4-20/20518@>.
В рассматриваемом случае физлицо не является покупателем ваших товаров (работ, услуг), поэтому при возврате займа ККТ применять не нужно.
Примечание
Устанавливается в размере величины прожиточного минимума трудоспособного населения города Москвы. Столичный МРОТ не включает в себя компенсации и надбавки за вредную (опасную) работу, сверхурочную работу, работу в ночное время, в выходные и праздники, а также за совмещение профессий и должностей