Передача прав на использование результатов интеллектуальной деятельности для целей НДС относится к услугам (ст.148 НК РФ).
Местом реализации услуг по передаче, предоставлению патентов, лицензий, торговых марок, авторских прав или иных аналогичных прав признается территория России, если покупатель услуг ведет в России свою деятельность <подп.4 п.1 ст. 148 НК РФ, Письма Минфина от 16.03.2018 N 03-07-14/16586, от 10.12.2019 N 03-07-14/95812 >.
В вашем случае покупатель деятельность в России не ведет. Следовательно, местом реализации услуг Россия не является. Начислять российский НДС не требуется (и лицензиар правомерно это не делает). Не нужно выставлять и счет-фактуру.
Напомним, что при этом надо вести раздельный учет, ведь у вас есть как облагаемые НДС операции, так и необлагаемые (п. 4 ст. 149, п. 4 ст. 170 НК РФ).