Да, можно. Поскольку на «доходно-расходной» упрощенке в составе расходов можно учитывать командировочные расходы <подп.13 п.1 ст.346.16 НК РФ, Письмо Минфина 27.06.2012 N 03-11-04/2/80>. В том числе и на проезд работника к месту командировки и обратно. Причем действующее Положение о командировках <утв. Постановлением Правительства РФ от 13.10.2008 N 749>, не содержит ограничений в отношении транспорта, которым может воспользоваться работник, а также каких-либо ограничений во времени поездки.