Командировочные расходы учитываются при налогообложении прибыли при условии их документального подтверждения (пп. 12 п. 1 ст. 264, п.1 ст. 252 НК РФ). Расходы на проезд на самолете подтверждаются авиабилетом или маршрут-квитанцией (контрольным купоном) электронного билета и посадочным талоном (п. п. 12, 22 Положения о командировках, утв. Постановление Правительства РФ от 13.10.2008 N 749, Письмо Минфина от 19.06.2015 N 03-03-07/35548).

Если авиабилет был приобретен третьим лицом, не являющимся работником организации, то, по мнению Минфина, затраты на его покупку можно учесть в расходах при налогообложении прибыли, если подтверждено, что билет куплен по поручению и за счет работника (Письма Минфина от 11.10.2012 N 03-03-07/46, от 19.10.2011 N 03-03-07/44). 

Для этого попросите работника написать служебную записку, в которой указать, что билет покупал, например, родственник по его поручению, и что деньги за покупку работник вернул. При этом к записке обязательно нужно приложить расписку этого человека о том, что он получил деньги с вашего работника и претензий к нему не имеет.