Вероятно, вы имеете в виду суммы налога, которые нужно отразить в самой справке 2-НДФЛ (Приложение № 1 к приказу ФНС от 30.10.2015 № ММВ-7-11/485@). Потому что в Реестре сведений о доходах физических лиц за отчетный год (который представляется вместе со справками 2-НДФЛ при их сдаче на бумаге) суммы НДФЛ вообще не отражаются (Приложение № 1 к Порядку, утв. Приказом ФНС России от 16.09.2011 № ММВ-7-3/576@).
А вот в справке 2-НДФЛ в разделе 5 в числе других общих сумм нужно указать:
- сумму налога исчисленную;
- сумму налога удержанную;
- сумму налога перечисленную.
Порядок отражения в справках 2-НДФЛ налога, удержанного из декабрьской зарплаты в январе при ее выплате, таков. Если на дату представления справок 2-НДФЛ в инспекцию вы налог у физлиц удержали и в бюджет заплатили, то его надо показать и как исчисленный, и как удержанный, и как перечисленный. Тот факт, что этот налог удержан и перечислен в бюджет в 2017 году, а не в 2016, значения не имеет (Письма ФНС от 02.03.2015 № БС-4-11/3283, от 03.02.2012 № ЕД-4-3/1692@).
Так что у вас не должно быть разниц между указанными строками раздела 5. Все суммы налога должны быть одинаковыми.
Разница между исчисленной суммой НДФЛ и удержанной и перечисленной будет только в том случае, если на момент представления справок 2-НДФЛ в ИФНС зарплата за декабрь еще не выплачена. Тогда после ее выплаты и удержания налога нужно представить «уточненные» справки 2-НДФЛ, где уже указать суммы налога как удержанные (Письмо ФНС от 02.03.2015 № БС-4-11/3283).