Поскольку вы не указали, о январе и феврале какого года идет речь, исходим из того, что это январь и февраль 2017 года.

1. Ежемесячные премии, предусмотренные трудовым и/или коллективным договором, положением о премировании, начисляемые за отработанные время и/или трудовые результаты, являются частью зарплаты, т.е. оплаты труда <ст. 129, 135 ТК>. В целях НДФЛ дата получения дохода в виде оплаты труда – последний день месяца <п. 2 ст. 223 НК>. В пользу этого подхода есть недавнее письмо ФНС <Письмо ФНС от 24.01.2017 N БС-4-11/1139@>.

В форме 6-НДФЛ такая ежемесячная премия отражается так же, как и оклад за тот же месяц (в разделе 2 – единым блоком строк 100 – 140). Если такая премия начислена за январь 2017 года, а выплачена в феврале 2017 года, то в строке 100 формы 6-НДФЛ за I квартал 2017 года нужно поставить 31.01.2017.

2. НДФЛ с зарплаты и с такой премии перечисляется одной платежкой, в поле 107 – МС.01.2017.

3. В разделе 3 справки 2-НДФЛ за 2017 год за январь у вас будет две отдельных строки: оклад с кодом 2000 и ежемесячная премия с кодом 2002.