Если вы не намерены оспаривать штраф, то достаточно его уплатить.

Штраф за невыполнение обязанностей налогового агента по удержанию и уплате налога <ст. 123 НК> не освобождает вас от обязанности представить уточненные расчеты. Напомним, налоговый агент обязан их сдать, если обнаружил в ранее представленном расчете неотражение или неполное отражение сведений, а также ошибки, приводящих к занижению или завышению суммы налога, подлежащей перечислению <п. 6 ст. 81 НК>.

За недостоверные сведения в 6-НДФЛ предусмотрен отдельный штраф <ст. 126.1 НК>. Но ФНС уточнила, что если указание недостоверных сведений не привело к потерям бюджета, то штраф должен быть смягчен <п. 3 Письма ФНС от 09.08.2016 N ГД-4-11/14515>. Кроме того, если сдать уточненный расчет 6-НДФЛ до того, как ошибку найдут налоговики, то штрафа можно избежать <п. 2 ст. 126.1 НК>.

Если же ошибка заключается в отражении зарплаты не в том периоде (например, операции по зарплате, выплаченной 31 марта, включили в разделы 1 и 2 формы 6-НДФЛ за I квартал и не включили в раздел 2 расчета за полугодие), то сдавать уточненки не нужно <Письмо ФНС России от 15.12.2016 N БС-4-11/24065@>. Ведь это не привело к искажению суммы налога, подлежащего уплате в бюджет.