Раздел 2 формы 6-НДФЛ предназначен для указания даты фактического получения дохода и удержания налога, срока перечисления налога и суммы фактически полученного дохода и удержанного налога <п. 4.1 Порядка заполнения, утв. Приказом ФНС от 14.10.2015 № ММВ-7-11/450>. НДФЛ с отпускных необходимо удерживать при их выплате <п. 4 ст. 226>. А перечислить его в бюджет нужно не позднее последнего числа месяца выплаты отпускных <п. 6 ст. 226>.

НДФЛ с отпускных, выплаченных в декабре 2016 года, нужно перечислить не позднее 31.12.2016. Но поскольку это суббота, то срок перечисления переносится на 09.01.2017, то есть уже на другой налоговый период. И хотя вы перечислили НДФЛ в бюджет уже 15.12.2016, операцию по выплате отпускных нужно указывать в разделе 2 формы 6-НДФЛ за 1 квартал 2017 года. В строке 120 этого расчета вы покажете дату - 09.01.2017.

В отчете за 2016 год в разделе 2 данные о выплате отпускных и перечислению с них НДФЛ показывать не нужно. А в разделе 1 НДФЛ с отпускных нужно показать по строкам 040 и 070 раздела 1 расчета за 2016 год <Письмо ФНС от 02.11.2016 № БС-4-11/20829>.

Что же касается справки 2-НДФЛ за 2016 г., то в ней налог с отпускных необходимо отражать в полях "Сумма налога исчисленная", «Сумма налога удержанная" и "Сумма налога перечисленная" <Письме ФНС России от 03.02.2012 N ЕД-4-3/1692@>.