Если работодатель применяет общий режим налогообложения и является сельхозпроизводителем, то с собственной продукции, выданной в счет зарплаты сотрудникам, НДС он не начисляет. Остальные работодатели на ОСН со стоимости выданных работникам товаров должны начислить НДС В момент выдачи заработной платы товаром право собственности на товар переходит сотруднику. Передача права собственности – это реализация. Счет – фактуру необходимо составить в одном экземпляре.

Выдавать зарплату в натуральной форме можно только по заявлению работника и только если это предусмотрено трудовым или коллективным договором. Натуральная часть не может превышать 20% начисленной зарплаты (ст. 131 ТК РФ, п. 54 Постановления Пленума ВС от 17.03.2004 N 2).