Пени считают со дня, следующего за сроком уплаты налога, по день фактической уплаты включительно. Например, если срок уплаты - 25-е число, а вы перечислили налог 29-го, пени начислят за 4 дня - с 26-го по 29-е (п. 3 ст. 75 НК РФ).
Конкретных сроков по уплате пеней не установлены. В любом случае, пени вы обязаны заплатить.