В качестве даты получения дохода в виде зарплаты по строке 100 всегда надо указывать последний день месяца, даже если он выпадает на выходной или праздник (Письмо ФНС от 16.05.2016 № БС-3-11/2169@). Поэтому по строке 100 вам нужно указать 31.12.2016. 

А вот по поводу заполнения строк 110 и 120 при досрочно выплаченной зарплате есть два письма ФНС, в которых отражены два разных мнения.

Мнение 1. Оно отражено в апрельском Письме ФНС (Письмо ФНС от 29.04.2016 № БС-4-11/7893). Так как по НК до истечения месяца доход в виде зарплаты не может считаться полученным, то до окончания месяца НДФЛ не может быть исчислен и удержан. И если зарплата выдана досрочно, то исчислить с нее НДФЛ можно только в последний день месяца, а удержать этот налог нужно при выплате денег работникам либо в последний день месяца, либо в следующем месяце. Соответственно, перечислить в бюджет удержанный НДФЛ нужно не позднее дня, следующего за днем выплаты дохода работникам. 

Если руководствоваться этим мнением, то при выплате зарплаты 27.12.2016 вам не следовало удерживать НДФЛ. А сделать это нужно только при перечислении зарплаты за первую половину января. 

Но вы налог удержали в декабре и в январе сделать это уже не сможете. Поэтому вам надо руководствоваться другим, более ранним разъяснением ФНС. 

Мнение 2. Оно отражено в мартовском Письме ФНС (Письмо ФНС от 24.03.2016 № БС-4-11/5106). Хотя месяц еще не окончен, датой получения оплаты труда все равно является последний день месяца, а не день выплаты зарплаты. Но при этом не страшно, что зарплата выплачена до окончания месяца и из нее удержан налог. В вашем случае раздел 2 расчета 6-НДФЛ надо заполнить так:

- по строке 100 «Дата фактического получения дохода» – 31.12.2016;

- по строке 110 «Дата удержания налога» – 27.12.2016;

- по строке 120 «Срок перечисления налога» – 28.12.2016. По этой строке нужно указать крайний срок перечисления налога в бюджет по нормам НК, а не фактический день  его перечисления (Письмо ФНС от 20.01.2016 № БС-4-11/546@). 

При таком заполнении расчета 6-НДФЛ вас не могут оштрафовать на 500 руб. за недостоверные сведения, поскольку вы руководствовались разъяснением ФНС (п. 1 ст. 126.1, подп. 3 п. 1 ст. 111 НК РФ, Постановление Президиума ВАС от 30.11.2010 № ВАС-4350/10). К тому же когда есть противоположные разъяснения контролирующих органов, все неясности и сомнения должны трактоваться в пользу налогового агента (п. 7 ст. 3 НК РФ).

В то же время имейте в виду, что некоторые налоговики на местах при отражении в расчете 6-НДФЛ досрочно выплаченной зарплаты в соответствии с разъяснениями 2, пытаются взыскать недоимку по НДФЛ (20% от суммы неуплаченного налога). Они мотивируют это тем, что в конце декабря уплачен вовсе не налог, а иной платеж из своих средств. Ведь на тот момент доход еще не был получен. Однако суды считают, что штраф незаконен. Событие и состав налогового правонарушения, предусмотренного ст. 123 НК РФ, возникает при нарушении срока, установленного НК РФ, только если НДФЛ в бюджет не поступил в необходимой сумме, то есть реально возникла недоимка. А вот если налоговый агент перечислили НДФЛ ранее даты, установленной НК РФ для исполнения обязанности по удержанию и (или) перечислению сумм налога, тогда нет события и состава налогового правонарушения, предусмотренного ст. 123 НК РФ (Постановление АС МО от 28.07.2016 № Ф05-5279/2015). Причем так думает большинство судов. Подробнее об этом вы можете прочитать в ГК, 2017, № 2, с. 56.