Расходы на оплату услуг нотариуса включаются в прочие расходы в пределах установленных тарифов (пп. 16 п. 1 ст. 264 НК РФ). Если вы оплатили нотариусу услуги правового или технического характера, то такие расходы вы можете включить в прочие расходы в полной сумме. Расходы на услуги нотариуса должны быть документально подтверждены (п. 1 ст. 252 НК РФ). Для учета этих расходов достаточно будет документа, выданного нотариусом.

Если организация оплачивает нотариальные услуги за директора, то это не расход организации. А соглашение можно и не делать. Просто не учитывайте эти суммы для налогообложения. Но если директор эту сумму не возместит потом, то это его доход, облагаемый НДФЛ, а может и страховыми взносами.

Нужно четко понимать, о каких услугах идет речь. Если услуги нотариуса не связаны с деятельностью компании (например, директор как физ. лицо удостоверяет сделку по продаже личного имущества), то, безусловно, это его личные расходы, которые не могут быть учтены в целях налогообложения. Но если речь идет, к примеру, об удостоверении нотариусом договора, доверенности и т.д., то их можно включить в расходы для налога на прибыль (пп. 14, 16 п. 1 ст. 264, пп. 14, 15 п. 1 ст. 346.16 НК РФ).