Из вопроса не совсем понятно, о каком документе, полученном в августе при отгрузке товара от бывшего ИП, идет речь. Отметим также, что при применении метода начисления перечисление предоплаты не признается расходом для целей налога на прибыль (п. 14 ст. 270 НК РФ). Вне зависимости от факта оплаты расходы учитываются на дату (пп. 1, 2 ст. 272, подп. 3 п. 1 ст. 268 НК РФ):
- списания сырья и материалов в производство;
- реализации товаров, приобретенных для перепродажи.
Но в любом случае принятие к учету первички, составленной бывшим ИП, несет определенные налоговые риски.
Так, если бывший ИП выставил вам счет-фактуру с НДС, то это однозначно незаконно: физлица – не ИП плательщиками НДС не являются (п. 1 ст. 143 НК РФ). И принять НДС к вычету на основании такого счета-фактуры вы не сможете.
Если вы заключите дополнительное соглашение к договору, по которому бывший ИП вернет вам сумму налога или вы договоритесь считать цену товара не включающей НДС без уменьшения цены, то это будет означать изменение цены, и НДС, принятый к вычету с аванса, нужно будет восстановить (подп. 3 п. 3 ст. 170 НК РФ).
В то же время, на наш взгляд, во избежание проблем с расходами по налогу на прибыль договор поставки с бывшим ИП лучше расторгнуть.
У ИП с момента расторжения договора прекратится обязательство по поставке товара и возникнет обязанность возвратить полученную предоплату, а вы сможете требовать возврата этой предоплаты (п. 2 – 4 ст. 453, п. 1 ст. 1102, п. 3 ст. 1103 ГК РФ).
А вернуть долг бывший ИП может тем самым товаром. Для этого можно заключить новый договор купли-продажи - как с обычным физлицом (если такие операци не носят систематический характер, то продавца не обвинят в незаконной предпринимательской деятельности). НДС в таком новом договоре быть уже не должно... Определитесь: либо на бывшую сумму НДС будет увеличена цена товара, либо бывший ИП вернет вам авансовый НДС.
При этом в периоде расторжения договора вы также должны будете восстановить НДС, принятый ранее к вычету с предоплаты.