Общая схема исправления ошибок в налоговом учете такова.
Ситуация 1. Выявили ошибку прошлых лет. Действуйте так:

<если> ошибка привела к переплате налога на прибыль и прошло меньше 3 лет со дня уплаты налога за тот год, к которому относится ошибка, то вы вправе исправить ее текущим периодом <п. 1 ст. 54 НК> – таким образом вы уменьшите налог за текущий год. Но вы вправе выбрать и другой вариант – пересчитать налог за период совершения ошибки, сдать уточненную декларацию и заявление о зачете либо возврате образовавшейся переплаты.
Обратите внимание: если за год, к которому относится ошибка, вы представили «нулевую» или «убыточную» декларацию (т.е. налог к уплате равен нулю), то нельзя считать, что ошибка привела к переплате налога. В этом случае выбора у вас нет: сдавайте уточненку <Письмо Минфина РФ от 07.05.2010 N 03-02-07/1-225>;

<если> ошибка привела к недоплате налога, нужно пересчитать налог на прибыль за период ее совершения, доплатить налог и пени и после этого сдать уточненку <п. 1 ст. 54, ст. 75, п. 1, подп. 1 п. 4 ст. 81 НК>. Однако если с окончания периода, за который совершена ошибка, прошло больше 3 лет, то можно не пересчитывать налог и не сдавать уточненку, т.к. проверить этот период инспекция уже не может.

Ситуация 2. Выявили ошибку текущего года. Действуйте так:
<если> ошибка привела к переплате авансовых платежей по налогу на прибыль, вы можете декларации за истекшие отчетные периоды не уточнять, а просто верно рассчитать налог по итогам года и переплату авансовых платежей учесть при перечислении налога за год;
<если> ошибка привела к недоплате авансовых платежей за истекшие отчетные периоды, нужно их пересчитать, доплатить суммы авансов и пени  и сдать уточненные декларации <п. 3 ст. 58 НК>.

О нюансах применения этой схемы вы можете прочитать в ГК 2013 № 6 стр. 22, ГК 2014 № 18 стр. 73.