До недавнего времени официальный подход и Минфина, и ФНС был такой. Вычет нужно предоставить с начала того месяца, когда работник принес вам заявление о предоставлении вычета и подтверждение ИФНС по установленной форме <утв. Приказом ФНС от 14.01.2015 № ММВ-7-11/3@>. То есть в вашем случае вычет нужно было представить с сентября 2015 г. Для того чтобы вернуть НДФЛ, удержанный и перечисленный вами в бюджет в качестве налогового агента за январь-август 2015 г., работник мог подать в 2016 г. декларацию за 2015 год по форме № 3-НДФЛ. Суммы НДФЛ, удержанные до получения заявления работника и подтверждения, не считались излишне удержанными, и, по мнению ведомств, у работодателя не было оснований для их возврата работнику в порядке ст. 231 НК РФ <Письма Минфина от 10.06.2015 № 03-04-05/33581, ФНС от 02.04.2013 № ЕД-2-3/217@>. Часть судов принимала решения в поддержку налоговиков.
Но в судебной практике сложился и другой подход, недавно поддержанный ВС РФ <п. 15 Обзора практики рассмотрения судами дел, связанных с применением главы 23 НК РФ (утв. Президиумом ВС РФ 21.10.2015)>. Суть его в следующем. Налоговый агент исчисляет НДФЛ нарастающим итогом с начала года <п. 3 ст. 226 НК РФ>. Подтверждение, выдаваемое ИФНС, подтверждает право гражданина на вычет за целый год, а не за отдельные месяцы. Поэтому после получения заявления работника и такого подтверждения организация вправе пересчитать НДФЛ с учетом имущественного вычета с начала года и вернуть работнику разницу в порядке ст. 231 НК РФ. В связи с этим мнением ВС РФ налоговая служба Письмом от 25.12.2015 № БС-4-11/22869@ отозвала одно из ранних разъяснений, содержавших запрет на возврат работодателем НДФЛ в такой ситуации <Письма ФНС от 22.12.2010 № ШС-37-3/18221@>.
Отметим, что Минфин и сейчас продолжает придерживаться прежней позиции <Письма Минфина от 25.12.2015 № 03-04-06/76144, от 24.12.2015 № 03-04-05/75893>. Однако, учитывая изменение позиции ФНС, полагаем, что вы можете произвести перерасчет и вернуть работнику НДФЛ за январь-август 2015 г. в порядке ст. 231 НК РФ. Претензий со стороны ИФНС теперь можно не опасаться.
