Все недополученные работником суммы, в том числе компенсация за неиспользованный отпуск, в случае его смерти выплачиваются членам его семьи или лицу, находившемуся на иждивении умершего (ст. 141 ТК РФ, ст. 1183 ГК РФ). Поскольку обязанность по уплате налога прекращается со смертью физлица-налогоплательщика (пп. 3 п. 3 ст. 44 НК РФ), а доход, получаемый в порядке наследования, НДФЛ не облагается (п. 18 ст. 217 НК РФ), то выплаченная компенсация не подлежит налогообложению НДФЛ (Письмо Минфина от 10.06.2015 N 03-04-05/33652). И, соответственно, компании не нужно исполнять функции налогового агента.