Как следует из вашего вопроса, вы правильно удержали налог у работника, но за месяц перечислили в бюджет лишнюю сумму НДФЛ за счет своих средств. Вы не можете зачесть ее в счет предстоящих платежей по НДФЛ, а можете только вернуть из бюджета. Для этого вам нужно подать в свою ИФНС заявление на возврат ошибочно перечисленной суммы, приложив к нему выписку из регистра по учету НДФЛ за соответствующий период и документы, подтверждающие излишнее перечисление налога в бюджет (платежки, бухгалтерские справки о выявлении ошибки, карточки по счетам бухучета 68 и 70)<п. 6 ст. 78, п. 1 ст. 231 НК РФ, Письма ФНС от 19.10.2011 № ЕД-3-3/3432@, и от 13.08.2014 № ПА-4-11/15988, Постановление АС ЗСО от 30.10.2015 N А67-8760/2014>. При этом дожидаться сдачи годовой отчетности не обязательно, но может понадобиться проведение сверки с ИФНС.