Документальным подтверждением командировочных расходов в целях налогообложения прибыли может являться авансовый отчет работника с приложенными к нему (пп. 12 п. 1 ст. 264, п.1 ст. 252 НК РФ, Письмо Минфина от 06.04.2015 N 03-03-06/2/19106):

(и) счетом из гостиницы, оформленным надлежащим образом;

(и) банковской выпиской операций по карте, с которой были списаны деньги за проживание в гостинице. 

Электронный документ может быть признан первичным документом, подтверждающим расходы в целях налогообложения прибыли, только в случае, если он оформлен в электронном виде и подписан электронной подписью (ч. 5 ст. 9 Закона от 06.12.2011 N 402-ФЗ, п. 1 ст. 11, ст. 313 НК РФ).

Если выписка получена через интернет посредством онлайн запроса, то при наличии электронной подписи она является электронным документом, который может подтверждать расходы для целей расчета налога на прибыль. 

Если же выписка получена без использования электронной подписи, такой документ не может быть принят к учету. Но вы можете попросить банк заверить полученную выписку, дабы она имела юридическую силу.