По решению суда акт от декабря 2014 г. подтверждает факт сдачи и приемки работ (то есть других актов от подрядчика вы уже не добьетесь). Из вашего вопроса не понятно, требовали ли вы от подрядчика в рамках этого судебного спора устранить недостатки и есть ли у вас документальное обоснование причин (кроме отсутствия акта по форме КС-2), из-за которых здание до сих пор не было введено в эксплуатацию.
Здание должно приниматься к учету в качестве основного средства, если оно соответствует признакам, установленным п. 4 ПБУ 6/01, и капитальные вложения по нему завершены. Причем государственная регистрация права для признания его основным средством не требуется (п. 52 Методических указаний, утв. Приказ Минфина РФ от 13.10.2003 N 91н). Заметим, что при проведении проверок налоговики тщательно исследуют документы на объекты незавершенных капвложений, чтобы определить, правомерно ли они отражены на счете 08 «Вложения во внеоборотные активы».
Поэтому если у вас не будет никаких документов о том, что после декабря 2014 г. здание доделывалось (устранялись недостатки) силами самой организации или каким-либо подрядчиком (то есть фактически строительство не закончено), то будет считаться, что именно в декабре 2014 г. здание было доведено до состояния, пригодного для использования в деятельности организации. А значит, оно признается основным средством (п.4 ПБУ 6/01, Письмо УФНС России по г. Москве от 06.05.2016 N 16-15/048499). И не приняв здание к учету в качестве ОС, вы допустили ошибку.
При этом ошибки за прошлые периоды в бухучете исправляются в периоде их обнаружения (п.9 ПБУ 22/2010). Существенные ошибки требуют ретроспективного пересчета. В вашем случае ошибка обнаружена на дату вынесения решения суда в ноябре 2016 г. То есть именно на эту дату нужно перевести здание на счет 01 «Основные средства». Затем нужно рассчитать амортизацию за весь период (начиная с января 2015 г.).
В налоговом учете исправления вносятся за период, когда ошибка была допущена (п.1 ст.54, п.1 ст.81 НК РФ). То есть вам нужно сдать уточненные налоговые декларации по налогу на имущество, уплатить по нему недоимку и пени. А по налогу на прибыль вы можете учесть доначисленные расходы в текущем периоде, если ошибка привела к переплате налога.
Если же у вас есть документы, которые подтверждают, что здание до сих пор не готово к эксплуатации, то переводить его на счет 01 «Основные средства» сейчас не нужно. Сделаете это, когда будут закончены все капвложения.