Если в 2018 году вы перечислите полную стоимость аренды за январь, исчисленную с учетом НДС 20%, никаких доплат в 2019 году вы не должны будете делать, и каких-либо рисков для вас не наблюдается.
Учтите только, что при перечислении аванса в 2018 году надо указывать старую ставку НДС - ведь повышенная ставка НДС еще не вступила в силу. И по старой ставке надо принимать «авансовый» НДС к вычету.
К примеру, общая сумма декабрьского аванса – 120 000 руб. Сумма НДС, которую должен исчислить с нее арендодатель, составит 18 305,08 руб. (120 000 *18/118). Именно эта сумма должна быть указана в «авансовом» счете-фактуре, который вам выпишут.
По завершении января 2019 г. арендодатель должен будет выставить вам обычный счет-фактуру с указанием НДС по ставке 20%: стоимость аренды без НДС – 100 000 руб., НДС – 20 000 руб.
На его основании вы сможете принять к вычету НДС в сумме 20 000 руб. Принятый ранее к вычету «авансовый» НДС надо будет восстановить в сумме 18305,08 руб., то есть по ставке 18/118.