Нерабочие дни - уникальный прецедент и потому точно на ваш вопрос о возможности работы в это время и последствиях такой работы не ответить.
Ст. 6.1 КоАП предусматривает ответственность организаций за нарушение санитарно-эпидемиологических правил, а ст. 5.27 - за нарушение трудового законодательства. К первой указ Президента, формально, не относится - там нет ничего о карантине и т.п. Ко второй - скорее всего, но сомнительно, что в ближайшее время вас проверит и накажет трудинспекция.
Если вы решили работать, оформляйте это как обычно, ставьте в табелях "Я" и т.д. Платите тоже в прежнем размере - это официальная позиция Минтруда.