Для начала вам надо определиться, что именно у вас происходит:
- или замена детали по гарантии – то есть вы высылаете поставщику бракованную деталь, а он взамен высылает вам рабочую,
- или вы просто получаете новую рабочую деталь от поставщика в рамках гарантии.
                При первом варианте можно получить освобождение от ввозного НДС. Подробнее об этом читайте в статье «Как не платить НДС при передаче товара для гарантийного ремонта за рубеж» (опубликована в ГК 2020, № 7, с. 31).
Если таможенный орган начислил вам НДС, а вы не хотите отстаивать свое освобождение, то можете действовать как при втором варианте.
При втором варианте если таможенный орган начислил вам ввозной НДС, а само оборудование, для ремонта которого получена деталь, используется в облагаемой НДС деятельности, у вас есть все основания для вычета такого НДС. Проводки в данном случае будут стандартные:
Дебет 19 – Кредит 76-«Расчеты с таможней» – начисление «ввозного» НДС, зачитываемого в счет ранее уплаченного таможне аванса;
Дебет 68-«НДС» – Кредит 19 – предъявление «ввозного»  НДС к вычету.