После перехода на прямые выплаты вы будете производить удержания по двум исполнительным документам только с той части больничного, которую выплачиваете. То есть, из суммы пособия за первые три дня болезни.
С суммы больничного, которую выплачивает отделение ФСС, оно само должно производить удержания.
При этом, у вас как работодателя нет обязанности пересылать в ФСС копии исполнительных документов. Вы можете это сделать только лишь для того, чтобы орган ФСС был в курсе (для информирования). Но отделение ФСС все равно на основании копий документов не будет производить удержания из выплачиваемого пособия по болезни. Как сообщают региональные отделения ФСС, для удержания им необходим оригинал исполнительного документа, выданный на имя отделения ФСС. И принести его должно лицо, в пользу которого производятся удержания, например, получатель алиментов. В противном случае, это лицо просто не получит алименты. Такие разъяснения содержатся на сайтах региональных отделений ФСС, в которых с 2021 года вводятся прямые выплаты, например, на сайте Санкт-Петербургского РО ФСС (http://rofss.spb.ru/pryamye-vyplaty.html), Пермского РО ФСС (http://r59.fss.ru/456200/463963/pvso_o_proekte_v19_k.pdf).
Так что вы можете (но не обязаны) сообщить об этом либо самому работнику, у которого производите удержания, либо получателю этих удержаний. И пусть уже они сами получают исполнительные документы (можно через судебных приставов) и представляют их в отделение ФСС.