С января применять вмененку могут только те организации и предприниматели, у которых не превышает 100 человек средняя, а не среднесписочная (как сейчас) численность.

А в расчет средней, помимо штатных, т.е. списочных, работников, включаются еще внешние совместители и исполнители и подрядчики по гражданско-правовым договорам.
Если у вмененщика в 2013 году средняя численность работников превысит 100 человек, ему придется заплатить налоги по общему режиму с начала квартала, в котором было допущено это нарушение (или по УСНО – если он подавал заявление на применение этого спецрежима).