Это если вы указали в документах организации (коллективном договоре, положении об оплате труда), что источником  выплаты премий является прибыль. Минфин считает такие премии выплаченными с «несоблюдением установленных условий» Письмо Минфина России от 28.12.2012 N 03-03-06/1/730.

Мол, раз прибыль отсутствует, значит выплачены премии, не предусмотренные трудовым или коллективным договорами.

С этим можно и поспорить, поскольку отсутствие прибыли не делает такие премии «дестимулирующими» начислениями работникам. Кроме того, убыточность компании может быть вызвана и иными обстоятельствами, к работе сотрудников отношения не имеющими – плохая коньюнктура, ошибки руководства, чрезвычайные обстоятельства и т.д.
Но у налоговиков действительно будет неплохой контраргумент - ваши же документы. Так что если вы планируете выплачивать премии и в таких ситуациях, то документы организации лучше, конечно, скорректировать – убрать из них подобные условия. И проверить, есть ли отсылка в трудовых договорах на эти акты – это тоже довольно частая претензия к премиям Письмо Минфина России от 22.09.2010 N 03-03-06/1/606.