Минфин предлагает это сделать через уменьшение величины физического показателя Письмо ФНС от 22.05.2013 N ЕД-3-3/1806@.

К примеру, 11 апреля вы встали на налоговый учет как плательщик ЕНВД по розничной торговле через магазин площадью 30 кв. м. Значит в декларации за II квартал в первом месяце (строка 050) надо указать 20 кв.м (30 кв. м. х 20/30), а во втором и третьем месяцах (строки 60 и 70) – по 30 кв.м.