Даже если в договоре купли-продажи жилья (комнаты, квартиры) вы разобьете продажную цену на две составные части – стоимость жилья и возмещение стоимости сделанного вами ремонта, это никоим образом не уменьшит НДФЛ. Такое разъяснение дал Минфин Письмо Минфина от 03.09.2013 № 03-04-05/36181

Ведь такая выплата как возмещение стоимости ремонта среди освобождаемых от НДФЛ доходов не поименована ст. 217 НК РФ. Так что вашим доходом является вся сумма, которую вы получили по договору купли-продажи, включая и возмещенную стоимость ремонта.

Но расстраиваться не стоит. Если на момент продажи жилье находилось у вас собственности 3 года и более, тогда вся сумма дохода от продажи жилья (включая и стоимость возмещенного ремонта) не будет облагаться НДФЛ подп. 17.1 ст. 217 НК РФ.
А  если на момент продажи жилье находилось у вас в собственности менее 3 лет, вы можете заявить имущественный вычет подп. 1 п. 1 ст. 220 НК РФ:
(или) в размере 1 млн руб., при этом документальное подтверждение расходов не требуется;
(или) в сумме денег, потраченных на приобретение этого жилья. Здесь расходы надо обязательно подтверждать документами.