Если вы реализуете товары (работы, услуги), облагаемые НДС, например, по ставкам 0% и 18%,  то в графе 16 книги покупок необходимо отразить только ту сумму входного налога, которую вы имеете право принять к вычету.

Источник: Письмо Минфина от 17 марта 2015 г. N 03-07-11/14238

Чтобы определить эту сумму, необходимо рассчитать, какая доля приобретенных товаров продана на территории России, а какая - на экспорт. И высчитать соответствующую сумму входного НДС, приходящегося на товары, реализованные по ставке 18%, а также по подтвержденной ставке 0%.

Если же впоследствии вы получите от поставщика исправленный или корректировочный счет-фактуру, то запись в книге покупок по этому счету-фактуре делается на сумму, определяемую с учетом рассчитанной ранее пропорции.