Оплачивая сотруднику жилье, пропишите это в трудовом договоре

Тогда затраты на наем жилья будут считаться зарплатой, выплаченной работнику в натуральной форме.

Источник: Письмо Минфина России от 19.05.2015 N 03-03-06/28809 Письмо Минфина России от 19.05.2015 N 03-03-06/28809

Соответственно, при расчете налога на прибыль их можно будет учесть в составе «зарплатных» расходов.

При этом не стоит забывать, что «натуральная» зарплата не может превышать 20% от трудовых доходов работника за месяц. Да и НДФЛ с нее удерживается в обычном порядке, т.е. с суммы оплаты за жилье нужно начислить налог.