Если организация занимается перевозками пассажиров или грузов, то при определении величины физического показателя базовой доходности необходимо учитывать не весь автопарк компании, а только тот транспорт, который будет непосредственно участвовать в облагаемой ЕНВД деятельности.

Источник: Письмо ФНС России от 10.06.2016 N СД-4-3/10366@

К примеру, на балансе организации числится 10 транспортных средств. При этом в перевозке пассажиров участвуют только 7 из них, а 3 транспортных средства сданы в аренду. Тогда физический показатель, необходимый для расчета суммы ЕНВД, будет равен именно 7.

К такому выводу еще в 2013 году пришел ВАС РФ (п.10 Информационного письма Президиума ВАС РФ от 05.03.2013 N 157), а налоговики взяли его на вооружение.