И в форме 6-НДФЛ, и в справках 2-НДФЛ есть графа «Сумма удержанного налога». Однако это не значит, что этот показатель в годовом расчете 6-НДФЛ и в справках 2-НДФЛ за аналогичный период будет одинаковым.

Источник: Письмо ФНС от 01.07.2016 № БС-4-11/11886@

Дело в том, что в случае, когда зарплата начислена в одном периоде (например, в декабре 2016 года), а фактически выплачена в другом (в январе 2017 года), в годовой 6-НДФЛ сумма налога, удержанного с начисленной в декабре зарплаты, не попадет. Ведь удержать НДФЛ с зарплатного дохода нужно при его фактической выплате (в данном случае в январе). В расчете за 2016 год эту сумму нужно будет указать только в строке 040 «Сумма исчисленного налога» раздела 1. А по строке 070 «Сумма удержанного налога» НДФЛ с декабрьской зарплаты в 6-НДФЛ за 2016 год не пройдет.

А вот в 2-НДФЛ суммы удержанного налога отражаются за тот налоговый период, к которому относится начисленный доход и за который исчислен этот НДФЛ. Причем, если налог был удержан уже после окончания отчетного года и после того, как справки 2-НДФЛ были представлены в ИФНС, придется сдать в инспекцию корректировки.

Так что, как видим, шансов, что суммы удержанного налога в справках 2-НДФЛ и расчете 6-НДФЛ, составленных по итогам одного и того же года, совпадут, немного. И ошибкой такое несовпадение не является.