Если структура нумерации счетов-фактур, принятая на предприятии, подразумевает новый отсчет номеров с начала каждого месяца, это не относится к ошибкам, препятствующим вычету НДС по таким документам.

Источник: Письмо Минфина от 12.01.2017 № 03-07-09/411

Так, некоторые компании выставляют счета-фактуры с номерами, в которых закодирован месяц их оформления. Например, документы за декабрь нумеруются 01-12, 02-12, 02-12 и т.д., а за февраль – 01-02, 02-02, 03-02 и так далее.

Как разъяснил Минфин, это не противоречит правилам оформления счетов-фактур. Ведь в НК сказано, что в счете-фактуры должен быть указан порядковый номер и дата составления. А отдельных требований к виду номера эта норма не содержит.

Кроме того, отказать в вычете НДС из-за погрешностей в оформлении счета-фактуры налоговики могут только в случаях, когда ошибка не позволяет идентифицировать продавца и/или покупателя товаров (работ, услуг), их стоимость, а также налоговую ставку и сумму налога. А особенности нумерации – явно не тот случай.