Налоговый агент по НДФЛ не вправе включить в договор с физлицом оговорку, согласно которой агент берет на себя обязательства по расходам, связанным с уплатой НДФЛ.

Источник: Письмо Минфина от 11.07.2017 № 03-04-06/43981

Организации, от которых или в результате отношений с которыми «физик» получил доходы, обязана исчислить, удержать и перечислить в бюджет НДФЛ с этих доходов. По общему правилу, налог удерживается из денежных доходов гражданина непосредственно при их фактической выплате. При этом уплата НДФЛ за счет средств налогового агента не допускается.

Эти нормы установлены Налоговым кодексом. Соответственно, при заключении с физлицом договора (трудового или ГПД) нельзя прописать, что НДФЛ за него будет платить организация из своих денег. Ведь это будет нарушением законодательства.